酶切时间(酶切不能超过16个小时)

牵着乌龟去散步 广角镜 9 0

大家好,今天来为大家分享酶切时间的一些知识点,和酶切不能超过16个小时的问题解析,大家要是都明白,那么可以忽略,如果不太清楚的话可以看看本篇文章,相信很大概率可以解决您的问题,接下来我们就一起来看看吧!

本文目录

  1. 快切酶酶切时间过长会怎样
  2. 单酶切问题
  3. 酶切技术的技术问题
  4. tarkara酶切质粒时间
  5. 双酶切37℃一般切多久
  6. 酶切的具体过程 怎么切的
  7. 双酶切时,是直接用pcr产物就可以,还是需要

一、快切酶酶切时间过长会怎样

非特异性切割、产物降解、反应终止、反应效率降低。

1、酶与非目标DNA序列结合,导致不必要的切割。

2、长时间的酶切会导致DNA降解,影响后续实验结果。

3、长时间的酶切会导致反应终止,无法完成所需的实验步骤。

4、长时间的酶切会导致酶活性降低,从而影响反应效率。

二、单酶切问题

1、首先明确一个问题,你的这个酶切位点在这个质粒中是唯一的吗,也就是说你只想把这个质粒切开吗?看你的结果好象这种可能性大些,那样我觉得最有可能是梅切不完全,即切开的线形质粒会比未切开的质粒跑得慢但两条带很相近。

2、建议:首先电泳时要有原质粒作对照,这样你就可以确定跑得快的带是不是未完全切开的质粒了。其次想酶切完全,可延长梅切时间,看你的体系酶的量足够了,而且酶的量本身也不应大于1/10;只是不知梅切的时间。最后若是可以确定两条带中有一条是切开的,则可以利用胶回收纯化的 *** 得到所需的这一载体,在和目的片段连接,注意这时凝胶回收是必要的,但若两条带太相近,则可能切的时候难分离;若是改变实验条件最终完全梅切(只一条带,且和原质粒位置有差异),则可以用加热65度20分钟的(对于37度酶) *** 将酶灭活直接用作连接载体即可,不用回收。

3、以上是假设你的载体这个酶切位点唯一的情况,若不是则会切下一小段片段,并且一定要凝胶回收才可得到连接载体。

三、酶切技术的技术问题

1、回收PCR产物:在进行PCR扩增时候,给引物两端设计好酶切位点,一般说来,限制酶的选择非常重要,尽量选择粘端酶切和那些酶切效率高的限制酶,如BamHI,HindIII,提前看好各公司的双切酶所用公用的BUFFER,以及各酶在公用BUFFER里的效率。选好酶切位点后,在各个酶的两边加上保护碱基。

双酶切时间及其体系:酶切过夜,其实完全没有必要,一般酶切3个小时,其实1个小时已经足够。应用大体系,如100微升。

纯化问题:纯化PCR产物割胶还是柱式,优选柱式,因为割胶手法不准,很容易割下大块的胶,影响纯化效率。现在的柱式纯化号称可以祛除引物,既然如此,酶切掉的几个碱基肯定也会被纯化掉了。所以,PCR产物和双酶切产物的纯化均可应用柱式纯化。优选TAKARA的纯化柱试剂盒。

酶量的问题:以TAKARA的为例,其对1单位酶的定义如下:在50μl反应液中,30℃温度下反应1小时,将1μg的λDNA完全分解的酶量定义为1个活性单位(U)。而该酶浓度约为15单位/微升,在除外酶降解的因素外,该酶可分解15μg的DNA,而一般从1-4ml菌液提出的DNA约为3μg,而PCR纯化后的产物(50体系)约为3μg,所以即便全部加进去,只要纯化的质量好,酶切完全切得动。

2、酶切、回收后的PCR产物与载体的连接

摩尔比的计算,回收的载体片段:回收的PCR产物片段=1:10,一般取前者0.03pmol,后者取0.3pmol。

pmol为单位的DNA转换为为μg单位的DNA:(Xpmoles×长度bp×650)/1,000,000(注:长度bp×650是该双链DNA的分子量)所得数值即为μg,也可以直接用这个公式套.1pmol1000bpDNA=0.66μg,如载体是5380bp,则0.03pmol为0.03×5.38×0.66=0.106524μg。

测DNA浓度可以在专用机子上测,注意OD值,一般约1.8-2.0.另外,如果嫌麻烦,也可用MARKER进行估测,如MARKER2000,5微升的MARKER每个条带约50ng。

连接反应:TAKARA的连接酶上的说明写的过夜,而其对连接酶单位的定义为:在20μl的连接反应体系中,6μg的λDNA-HindIII的分解物在16℃下反应30分钟时,有90%以上的DNA片段被连接所需要的酶量定义为1个活性单位(U)。而它的浓度为350U/μl,所以完全够用。连接酶容易失活,注意低温操作。时间3个小时足已。

a、全量(10μl)加入至100μlJM109感受态细胞中,冰中放置30分钟。

b、42℃加热45秒钟后,再在冰中放置1分钟。

c、加入890μlAMP阴性培养基,37℃振荡培养60分钟。

取100μl铺板。也可离心后余100μl。

四、tarkara酶切质粒时间

tarkara酶切质粒时间是四个小时。酶切是根据酶切样品的量跟酶切体系中酶的活性来确定的,是酶切PCR产物的话,跟你所加的保护碱基数目也是有关的。做酶切的时候加的酶都是过量的,切三四个小时,保证获得足够干净的载体,切载体时间太短的话,载体不容易纯化掉,就会混入到你的连接产物中影响连接效率,很难挑到构建的克隆,酶切时间不宜太长,太长的话会把载体给切碎掉,有一些有星号活性的酶,切的时间稍长载体就会碎掉,影响你的实验结果。

五、双酶切37℃一般切多久

双酶切是一种常用的分子生物学技术,用于在特定的DNA序列上引入切口。在实验中,通常使用两种限制性内切酶来进行双酶切。这些限制性内切酶能够识别特定的DNA序列,并在该序列的特定位置切割DNA分子。在进行双酶切时,会将目标DNA与适当的缓冲液和限制性内切酶一起反应。温度是一个重要的因素,常规的双酶切反应温度为37℃。这个温度是因为大多数限制性内切酶在37℃下具有较高的活性。切割的时间可以根据实验需要进行调整,但一般情况下,双酶切的反应时间为3-4小时。这个时间足够限制性内切酶与目标DNA发生特异性的结合和切割反应。而对于某些特殊的酶或特定的实验要求,切割时间可能会有所不同。

六、酶切的具体过程 怎么切的

1、完全酶切:用足够的限制性内切酶以充分的时间去处理DNA分子,使DNA中所有可能的靶位点都被切割。

2、部分酶切:限制酶处理DNA时因酶量或反应时间不足,以致DNA的靶位点只有一部分被裂解。

3、完全酶切:长度不均一,是黏性末端,但有可能使目的基因断开,大小不可控。

4、部分酶切:片段长度可控,含有黏性末端便于连接,目的基因完整。

七、双酶切时,是直接用pcr产物就可以,还是需要

在进行PCR扩增时候,给引物两端设计好酶切位点,一般说来,限制酶的选择非常重要,尽量选择粘端酶切和那些酶切效率高的限制酶,如BamHI,HindIII,提前看好各公司的双切酶所用公用的BUFFER,以及各酶在公用BUFFER里的效率。选好酶切位点后,在各个酶的两边加上保护碱基。

双酶切时间及其体系:需要强调的是很多人建议酶切过夜,其实完全没有必要,我一般酶切3个小时,其实1个小时已经足够。应用大体系,如100微升。

纯化问题:纯化PCR产物割胶还是柱式,我推荐柱式,因为割胶手法不准,很容易割下大块的胶,影响纯化效率。现在的柱式纯化号称可以祛除引物,既然如此,酶切掉的几个碱基肯定也会被纯化掉了。所以,PCR产物和双酶切产物的纯化均可应用柱式纯化。我用的是TAKARA的纯化柱试剂盒

酶量的问题:以TAKARA的为例,其对1单位酶的定义如下:在50μl反应液中,37℃温度下反应1小时,将1μg的λDNA完全分解的酶量定义为1个活性单位(U)。而该酶浓度约为15单位/微升,在除外酶降解的因素外,该酶可分解15μg的DNA,而一般从1-4ml菌液提出的 DNA约为3μg,而PCR纯化后的产物(50体系)约为3μg,所以即便全部加进去,只要纯化的质量好,酶切完全切得动。

酶切时间(酶切不能超过16个小时)-第1张图片-

2、酶切、回收后的PCR产物与载体的连接

摩尔比的计算,很多人凭经验也可以。但对于初学者从头认真计算则非常有必要。回收的载体片段:回收的PCR产物片段=1:3到1:10,一般取前者0.03pmol,后者取0.3pmol。

pmol为单位的DNA转换为为μg单位的DNA:(X pmoles×长度bp×650)/ 1,000,000(注:长度bp×650是该双链DNA的分子量)所得数值即为μg,也可以直接用这个公式套.1pmol 1000bp DNA=0.66μg,如载体是5380bp,则0.03pmol为

0.03×5.38×0.66=0.106524μg。

测DNA浓度测定可使用微量可见光分光光度计或者可以使用艾本德的BioPhotometer核酸蛋白分析仪,注意OD值,一般约1.7-1.9.的说明写的过夜,而其对连接酶单位的定义为:在20μl的连接反应体系中,6μg的λDNA-Hind III的分解物在16℃下反应30分钟时,有90%以上的DNa段被连接所需要的酶量定义为1个活性单位(U)。而它的浓度为350 U/μl,所以完全够用。连接酶容易失活,注意低温操作,更好在冰上。时间3个小时足已。

a、一般转化仅需要加入2μl加入至100μl正常的TOP10感受态细胞中,冰浴放置30分钟。

b、再在水浴中42℃热激一般90~120秒钟后,再在冰中放置3分钟。

c、加入800μl无抗生素培养基,37℃全温振荡摇床培养40分钟。

取100μl涂布平板。一般转化质粒不建议离心涂布(除非感受态效价特别低),

1做转化质粒的时候一般不加连接酶。对PCR产物进行酶连接反应时,注意保持低温状态,因为T4连接酶长时间放置在常温下容易活性降低,建议在冰盒中操作。

2对含有AMP-RESISTENCE的质粒涂布时,一般培养基会放置在培养箱中一段时间后才会到感受态中,

为验证双酶切是否成功,可做如下对照:

A酶切反应时加各单酶分别切,两管,用同一种BUFFER,跑胶,看单切的两管是否成线性.如两管均成线性可初步判断双酶切成功.

做转化时,也要进行对照.设4个:

A.即拿双酶切的质粒产物也进行连接反应,这个对照可进一步看双酶切是否成功,如果长出克隆,说明很有可能只进行了单酶切,如没长出克隆,则证明双酶切成功,当然要保证感受态,培基,连接酶都'正常'的情况下.

B.酶切过的未进行连接反应的双酶切产物,进行转化,这一步可以证明是否有残留的未被任何酶切的原始质粒

C.设原始质粒为对照,意为检测整个操作过程中是否有误.

D.AMP阴性板上用同一批感受态细胞铺板20微升足够,检测感受态状况.

4.所有的试剂切记低温保存.一步一个脚印.不要偷懒,图省事最后却更费事.注意设立对照。

经PCR鉴定,克隆90%-100%的阳性率,所以在后面的挑克隆中,我只挑选4个就足够了。然后双酶切鉴定,测序。

关于酶切时间和酶切不能超过16个小时的介绍到此就结束了,不知道你从中找到你需要的信息了吗 ?如果你还想了解更多这方面的信息,记得收藏关注本站。

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